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      植物激素(plant hormones)是指在植物体内合成的、通常从合成部位运往作用部位、对植物的生长发育产生显著调节作用的微量有机物质。基迪奥基于LC-MS/MS平台的植物激素检测分析方法,可以检测并绝对定量6大类植物激素:生长素(Auxin)、细胞分裂素(Cytokinins,CKs)、脱落酸(Abscisic acid,ABA)、茉莉酸(Jasmonates,JAs)、水杨酸(Salicylic acid,SA)、赤霉素(Gibberellins,GAs)。掌握植物体内激素的组成以及在不同环境、处理下含量的变化,可更深入地研究植物发育、分子遗传和细胞生物学等作用机理。

       

      应用领域

      1. 植物生长发育机制研究
      2. 植物抗生物和非生物胁迫应答机制

       

       

      技术路线

       

      分析内容

       

      1. 标准信息分析
      a) 物质标准曲线绘制
      b) 原始数据预处理
      c) 物质绝对定量
      d) 差异代谢物筛选
      2. 定制化信息分析
      a) 差异代谢物KEGG代谢通路分析
      b) 代谢物层次聚类分析

       

       

      样品要求

      植物组织:鲜样1g以上,尽量提供植物幼嫩组织

       

      项目周期

      标准项目的运转周期是60个工作日

       

       

      参考文献

      [1] Du F, Ruan G, Liu H. Analytical methods for tracing plant hormones[J]. Analytical and bioanalytical chemistry, 2012, 403(1): 55-74.

      [2] Ma Z, Ge L, Lee A S Y, et al. Simultaneous analysis of different classes of phytohormones in coconut (Cocos nucifera L.) water using high-performance liquid chromatography and liquid chromatography–tandem mass spectrometry after solid-phase extraction[J]. Analytica chimica acta, 2008, 610(2): 274-281.

       

       

       

       

       

       

       

      Q1: 如何评判样本能否做代谢组或蛋白组(比如-80℃保存了两年、或者用麻醉剂进行处理)?

      A: 针对这种情况要咨询公司销售,评估样本的可检测性。一般情况下,样本-80℃保存半年对蛋白、代谢检测影响不大,可正常使用。如果保存时间更久,可与销售咨询,进行预实验,通过预实验的检测结果判断样本情况。

       如果使用麻醉剂等试剂对样本进行预处理,对物质检测结果一定会有影响的。

       

       

      Q2: 蛋白、代谢检测可否分批送样?

      A: 不建议分批送样,因为仪器稳定性、实验操作人员不同、质谱仪保养清洁等原因会导致不同批次检测结果出现明显的批次效应,且批次效应很难消除,有时批次间的差异会大于样本间的差异。如果真的由于试验需要时间梯度或者样本自身原因,建议先取样,用液氮猝灭后至于-80℃保存,等到所有样本收集完再统一检测。

       

       

      Q3: 代谢组检测时什么是外标?什么是内标?如果检测时添加了内标就是内标法检测吗? 

      A: 外标是指代谢物检测时,使用的与待检物质一致的标准品。因为标准品的浓度和上机检测量是已知的,用不同浓度的标品,构建标曲获得峰面积,之后利用标曲的峰面积,标曲浓度、待检物质的峰面积可推算出待检物质浓度,实现待检物质的绝对定量和定性。

       

      内标是指代谢物检测时,用到的是待检物质的同位素。同位素与待检物质一起上机检测。因为同位素的浓度和上机量已知,可根据同位素的峰面积和待检物质的峰面积推测待检物质含量,实现待检物质的相对定量和定性。添加内标不一定是内标法检测。有些公司会使用“外标+同位素内标绝对定量”,这种情况下,外标用于待检物质的绝对定量和定性,内标用于矫正样本量不容导致的定量差异,消除基质对定量的影响。

       

       

       

       

       

      转录组+代谢组关联揭示玉米叶片的防御机制

      合作单位:中国农业科学院植物保护研究所

      发表期刊:Plant Biotechnology Journal   

       影响因子IF:6.305

       

      研究背景

      玉米在受到害虫为害后,会产生对昆虫具有忌避、拒食或(和)毒杀作用的直接抗虫物质,如苯并恶嗪酮类物质,也会产生引诱害虫的捕食性或寄生性天敌的间接抗虫物质,如吲哚、萜烯等。

       

      实验取材

      玉米螟摄食0、2、4、12、24h后的叶片,各3个重复,每个重复4-5份植物样本混合。

       

       

       

      研究结果

      1.基因的差异表达分析

      一共检测到41,009个表达的基因,在玉米螟摄食0、2、4、12、24h后,分别检测到7,643、9,037、10,190、10,033个基因发生了差异表达。

      2.差异基因的功能富集分析

      KEGG富集分析表明,差异基因与植物激素、苯并恶唑嗪酮和挥发性物质的代谢通路有关。

       

       

      3.苯并恶唑嗪酮类代谢物的变化趋势

      亚洲玉米螟摄食后,对苯并恶嗪类丰度有很大影响。

      HDM2BOA-Glc,48小时的峰值水平为291倍。 HDMBOA-Glc,HM2BOA-Glc,DIM2BOA-Glc和MBOA也显着上调,并在24小时显示最高诱导水平,增加24.9-54.6倍。

      亚洲玉米螟摄食后,也引起苯并恶嗪类基因表达的显著变化。除了BX1,BX5,BX7和BX8之外的所有BX基因在亚洲玉米螟喂养期间显著上调。

       

      4.挥发性代谢物的含量变化趋势

      在0(对照),以及亚洲玉米螟摄食2,4,12,24,48和72小时后的样本中,共收集到26种挥发性化合物,挥发性化合物b-石竹烯,香柠檬酸,芳樟醇等化合物的浓度显着增加,并且在亚洲玉米螟喂养的24或48小时达到峰值。

      与对照相比,萜烯生物合成相关基因TPS1,TPS2,TPS3,TPS6,TPS8,TPS10,TPS23和TPS26在所有时间点都被强烈上调

       

       

       

       

      参考文献

      Guo Jingfei,Qi Jinfeng,He Kanglai,Wu Jianqiang,Bai Shuxiong,Zhang Tiantao,Zhao Jiuran,Wang Zhenying. The Asian corn borer Ostrinia furnacalis feeding increases the direct and indirect defence of mid-whorl stage commercial maize in the field.[J]. Plant biotechnology journal,2018.

       

       

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